Afni

AFNI: ภาพรวม

AFNI เป็นสภาพแวดล้อมโอเพนซอร์สสำหรับการประมวลผลและแสดงผลข้อมูล fMRI (functional magnetic resonance imaging) ซอฟต์แวร์นี้พัฒนาขึ้นหลักๆ เพื่อการวิเคราะห์และแสดงผลข้อมูลกายวิภาค, fMRI, และ diffusion-weighted (DW) [1][2][5] AFNI พร้อมใช้งานฟรีสำหรับวัตถุประสงค์การวิจัยภายใต้ใบอนุญาตสาธารณะทั่วไปของ GNU (GPL) ส่วนใหญ่ของซอฟต์แวร์เขียนขึ้นที่วิทยาลัยแพทยศาสตร์วิสคอนซิน ซึ่งเป็นเจ้าของลิขสิทธิ์ของโค้ดนั้น [1][2]

ภาพรวม

AFNI เริ่มแรกพัฒนาขึ้นที่วิทยาลัยแพทยศาสตร์วิสคอนซิน เริ่มต้นในปี 1994 โดย Robert W. Cox Cox นำการพัฒนานี้ไปยัง NIH ในปี 2001 และยังคงได้รับการพัฒนาอย่างต่อเนื่องโดย NIMH Scientific and Statistical Computing Core [2]

เหตุการณ์สำคัญในประวัติศาสตร์และการเติบโตของบริษัท

นับตั้งแต่ก่อตั้ง AFNI ได้พัฒนาขึ้นอย่างมาก ในปัจจุบันประกอบด้วยโค้ดต้นทาง C มากกว่า 300,000 บรรทัด และรวมถึงเครื่องมือต่างๆ สำหรับการประมวลผลข้อมูล การแสดงผล และการวิเคราะห์ ซอฟต์แวร์ได้รับการอัปเดตอย่างต่อเนื่องเพื่อตอบสนองความต้องการของนักวิจัยภาพสมอง [2]

ข้อกำหนดทางกฎระเบียบและใบอนุญาต

AFNI แจกจ่ายฟรีภายใต้ใบอนุญาตสาธารณะทั่วไปของ GNU (GPL) ส่วนประกอบ SVM-light ที่รวมอยู่ในนั้นเป็นแบบไม่แสวงหาผลกำไรและไม่สามารถแจกจ่ายได้ [1][2]

ผลิตภัณฑ์และบริการของ AFNI

ผลิตภัณฑ์หลักของ AFNI

ประเภทของเครื่องมือวิเคราะห์และแสดงผล

AFNI รวมชุดของโปรแกรม C, Python, และ R และ shell scripts ซอฟต์แวร์นี้มีเครื่องมือสำหรับการแก้ไขการเคลื่อนไหว การปรับให้เรียบ และการวิเคราะห์การถดถอยของข้อมูล fMRI ซอฟต์แวร์ยังรวมถึง SUMA (Surface models, and Mapping volumetric data onto them) ซึ่งช่วยให้ผู้ใช้สามารถฉายข้อมูล 2 มิติไปยังแผนที่พื้นผิวคอร์เทกซ์ 3 มิติได้ [1][2][5]

ตัวเลือกการครอบคลุมและรายละเอียดนโยบาย

AFNI เสนอเครื่องมือสำหรับการประมวลผลข้อมูล fMRI ก่อนการประมวลผล สคริปต์ "afni_proc.py" ทำงานข้อมูล fMRI จากหัวเรื่องเดียวผ่านขั้นตอนการประมวลผลก่อนการประมวลผลหลายขั้นตอน รวมถึงการแก้ไขการเคลื่อนไหวและการปรับให้เรียบ [2]

บริการเพิ่มเติม

บริการอื่นๆ ที่ให้บริการ

AFNI มีความสามารถในการประมวลผลแบบโต้ตอบและแบบแบตช์ ผู้ใช้สามารถรวบรวมโปรแกรมอย่างยืดหยุ่นโดยใช้ shell scripts หรือเรียกใช้แบบโต้ตอบ ซอฟต์แวร์ออกแบบมาเพื่อใช้งานบนระบบ Unix ทุกระบบที่มี X11 และ Motif displays [1][2][5]

การใช้งานและการติดตั้ง AFNI

โครงสร้างราคา

ภาพรวมของเวอร์ชัน AFNI

AFNI มีให้ในหลายเวอร์ชัน รวมถึง 2021.6.10 และ 2024.10.14 ผู้ใช้สามารถโหลดเวอร์ชันที่เฉพาะเจาะจงโดยใช้คำสั่ง `module load afni/version` [1]

การวิเคราะห์เปรียบเทียบกับค่าเฉลี่ยของอุตสาหกรรม

ไม่มีการเปรียบเทียบโดยตรงกับค่าเฉลี่ยของอุตสาหกรรมเนื่องจาก AFNI เป็นซอฟต์แวร์เฉพาะสำหรับการวิจัยภาพสมอง

ส่วนลดและข้อเสนอพิเศษ

ส่วนลดที่สามารถใช้ได้

ไม่มีส่วนลดหรือข้อเสนอพิเศษใดๆ ที่ AFNI มอบให้ เนื่องจากเป็นซอฟต์แวร์โอเพนซอร์สฟรี

ข้อเสนอส่งเสริมการขายและข้อเสนอจำกัดเวลา

ไม่มีข้อเสนอส่งเสริมการขายหรือข้อเสนอจำกัดเวลาใดๆ ที่มีให้สำหรับ AFNI

การสนับสนุนลูกค้าของ AFNI

วิธีการติดต่อ

ช่องทางบริการลูกค้าที่มีอยู่

ผู้ใช้สามารถติดต่อฝ่ายสนับสนุนของ AFNI ผ่านทางกระดานข้อความของ AFNI: https://afni.nimh.nih.gov/afni/community/board [2]

ความพร้อมใช้งานของการสนับสนุนตลอด 24 ชั่วโมงและความช่วยเหลือหลายภาษา

AFNI ไม่ได้ให้การสนับสนุนตลอด 24 ชั่วโมงหรือความช่วยเหลือหลายภาษา อย่างไรก็ตาม ผู้ใช้สามารถขอความช่วยเหลือผ่านกระดานชุมชนหรือติดต่อ NIMH Scientific and Statistical Computing Core โดยตรง

ข้อดีและข้อเสียของ AFNI

ข้อดี

ข้อดีของการเลือก AFNI

เครื่องมือครอบคลุมสำหรับการวิเคราะห์และแสดงผลข้อมูล fMRI

พร้อมใช้งานฟรีภายใต้ GPL

ได้รับการพัฒนาอย่างต่อเนื่องโดย NIMH Scientific and Statistical Computing Core [1][2]

เหมาะสำหรับวัตถุประสงค์การวิจัยเนื่องจากมีความยืดหยุ่นและสามารถปรับแต่งได้

ข้อเสีย

ข้อเสียที่อาจเกิดขึ้นหรือพื้นที่สำหรับการปรับปรุง

เส้นโค้งการเรียนรู้สูงเนื่องจากความซับซ้อนและความสามารถในการปรับแต่ง

ตัวเลือกการสนับสนุน จำกัด เมื่อเทียบกับซอฟต์แวร์เชิงพาณิชย์

บทสรุป

AFNI เป็นชุดซอฟต์แวร์โอเพนซอร์สที่ทรงพลังสำหรับการวิเคราะห์และแสดงผลข้อมูล fMRI

ซอฟต์แวร์นี้มีเครื่องมือมากมายสำหรับการประมวลผลก่อนการประมวลผล การแสดงผล และการวิเคราะห์

AFNI ใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิจัยภาพสมอง และพร้อมใช้งานฟรีภายใต้ GPL

คำแนะนำเกี่ยวกับใครจะได้รับประโยชน์สูงสุดจากข้อเสนอประกันของบริษัท

นักวิจัยและนักวิทยาศาสตร์ที่ทำงานกับข้อมูล fMRI จะได้รับประโยชน์สูงสุดจากการใช้ AFNI

คำถามที่พบบ่อยเกี่ยวกับ AFNI

คำตอบสำหรับคำถามทั่วไปเกี่ยวกับนโยบายของบริษัท ขั้นตอนการเรียกร้อง และอื่นๆ

วิธีการตั้งค่า AFNI บนระบบ Unix: ผู้ใช้สามารถโหลด AFNI โดยใช้คำสั่ง `module load afni` และเลือกเวอร์ชันที่เฉพาะเจาะจงโดยใช้ `module load afni/version` [1]

วิธีการใช้ SUMA: SUMA ช่วยให้ผู้ใช้สามารถฉายข้อมูล 2 มิติไปยังแผนที่พื้นผิวคอร์เทกซ์ 3 มิติได้ ทำให้เห็นภาพของรูปแบบการกระตุ้นได้อย่างละเอียด [2]

วิธีการอ้างอิง AFNI: ผู้ใช้ควรอ้างอิง AFNI ดังต่อไปนี้: RW Cox. AFNI: Software for analysis and visualization of functional magnetic resonance neuroimages. Computers and Biomedical Research, 29:162-173, 1996 [4]

อ้างอิง

[1] https://www.osc.edu/resources/available_software/software_list/afni

[2] https://en.wikipedia.org/wiki/Analysis_of_Functional_NeuroImages

[3] https://cbmm.mit.edu/afni

[4] https://help.rc.ufl.edu/doc/AFNI

[5] https://afni.nimh.nih.gov